Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCML1Q9UN30 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML1Q9UN30 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms