Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PADI4Q9UM07 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI4Q9UM07 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms