Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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