Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC2Q9UKJ5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC2Q9UKJ5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms