Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSKSQ9UJT2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms