Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms