Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms