Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms