Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms