Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms