Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFT172Q9UG01 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
IFT172Q9UG01 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
IFT172Q9UG01 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
IFT172Q9UG01 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms