Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9Q9P2J2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms