Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
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