Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC15Q9P013 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC15Q9P013 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms