Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF12Q9NZN5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms