Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ3

GTSE1, G2 and S phase-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSE1Q9NYZ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTSE1Q9NYZ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSE1Q9NYZ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms