Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL28Q9NXS3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL28Q9NXS3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.3 ms