Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms