Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms