Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms