Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms