Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms