Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARCH5Q9NX47 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH5Q9NX47 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms