Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF2Q9NX18 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF2Q9NX18 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms