Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM248Q9NWD8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM248Q9NWD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms