Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCLQ9NW38 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms