Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCAF13Q9NV06 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCAF13Q9NV06 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCAF13Q9NV06 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCAF13Q9NV06 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DCAF13Q9NV06 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DCAF13Q9NV06 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms