Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTLC3Q9NUV7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms