Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms