Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms