Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF275Q9NSD4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms