Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms