Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms