Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSHZ2Q9NRE2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSHZ2Q9NRE2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHZ2Q9NRE2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSHZ2Q9NRE2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms