Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms