Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST12Q9NRB3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms