Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR8Q9NR97 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR8Q9NR97 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms