Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPHNQ9NQX3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms