Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS4Q9NQG7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS4Q9NQG7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS4Q9NQG7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS4Q9NQG7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS4Q9NQG7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS4Q9NQG7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS4Q9NQG7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS4Q9NQG7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS4Q9NQG7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms