Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms