Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED4Q9NPJ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED4Q9NPJ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms