Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms