Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms