Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE7BQ9NP56 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms