Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms