Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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