Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms