Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRKRIP1Q9H875 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms