Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms