Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF1DQ9H5J8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms